Protein–RNA interactions for Protein: P28336

NMBR, Neuromedin-B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMBRP28336 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NMBRP28336 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NMBRP28336 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NMBRP28336 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NMBRP28336 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NMBRP28336 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NMBRP28336 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NMBRP28336 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
NMBRP28336 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NMBRP28336 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NMBRP28336 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NMBRP28336 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NMBRP28336 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NMBRP28336 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
NMBRP28336 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NMBRP28336 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NMBRP28336 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NMBRP28336 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NMBRP28336 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NMBRP28336 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NMBRP28336 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
NMBRP28336 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NMBRP28336 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NMBRP28336 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NMBRP28336 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NMBRP28336 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NMBRP28336 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NMBRP28336 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NMBRP28336 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
NMBRP28336 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NMBRP28336 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NMBRP28336 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NMBRP28336 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NMBRP28336 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NMBRP28336 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NMBRP28336 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NMBRP28336 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NMBRP28336 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NMBRP28336 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NMBRP28336 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NMBRP28336 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NMBRP28336 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NMBRP28336 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NMBRP28336 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NMBRP28336 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NMBRP28336 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NMBRP28336 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NMBRP28336 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NMBRP28336 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NMBRP28336 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NMBRP28336 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NMBRP28336 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NMBRP28336 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NMBRP28336 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NMBRP28336 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NMBRP28336 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NMBRP28336 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NMBRP28336 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NMBRP28336 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NMBRP28336 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NMBRP28336 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NMBRP28336 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NMBRP28336 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NMBRP28336 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NMBRP28336 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NMBRP28336 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NMBRP28336 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NMBRP28336 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NMBRP28336 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NMBRP28336 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NMBRP28336 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NMBRP28336 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NMBRP28336 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NMBRP28336 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NMBRP28336 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NMBRP28336 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NMBRP28336 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NMBRP28336 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NMBRP28336 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NMBRP28336 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NMBRP28336 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NMBRP28336 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NMBRP28336 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NMBRP28336 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NMBRP28336 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NMBRP28336 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NMBRP28336 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NMBRP28336 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NMBRP28336 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NMBRP28336 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NMBRP28336 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NMBRP28336 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NMBRP28336 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NMBRP28336 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NMBRP28336 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NMBRP28336 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NMBRP28336 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NMBRP28336 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NMBRP28336 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NMBRP28336 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms