Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SSFA2P28290 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SSFA2P28290 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SSFA2P28290 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SSFA2P28290 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SSFA2P28290 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SSFA2P28290 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SSFA2P28290 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SSFA2P28290 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SSFA2P28290 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SSFA2P28290 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SSFA2P28290 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SSFA2P28290 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SSFA2P28290 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SSFA2P28290 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SSFA2P28290 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SSFA2P28290 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SSFA2P28290 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SSFA2P28290 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SSFA2P28290 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SSFA2P28290 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SSFA2P28290 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SSFA2P28290 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SSFA2P28290 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SSFA2P28290 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SSFA2P28290 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SSFA2P28290 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SSFA2P28290 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SSFA2P28290 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SSFA2P28290 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SSFA2P28290 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SSFA2P28290 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SSFA2P28290 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SSFA2P28290 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SSFA2P28290 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SSFA2P28290 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SSFA2P28290 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SSFA2P28290 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SSFA2P28290 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SSFA2P28290 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SSFA2P28290 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SSFA2P28290 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SSFA2P28290 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SSFA2P28290 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SSFA2P28290 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SSFA2P28290 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SSFA2P28290 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SSFA2P28290 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SSFA2P28290 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SSFA2P28290 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SSFA2P28290 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SSFA2P28290 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SSFA2P28290 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SSFA2P28290 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SSFA2P28290 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SSFA2P28290 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SSFA2P28290 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SSFA2P28290 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SSFA2P28290 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SSFA2P28290 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SSFA2P28290 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SSFA2P28290 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SSFA2P28290 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SSFA2P28290 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SSFA2P28290 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SSFA2P28290 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SSFA2P28290 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SSFA2P28290 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SSFA2P28290 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SSFA2P28290 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SSFA2P28290 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SSFA2P28290 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SSFA2P28290 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SSFA2P28290 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SSFA2P28290 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SSFA2P28290 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SSFA2P28290 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SSFA2P28290 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SSFA2P28290 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SSFA2P28290 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SSFA2P28290 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SSFA2P28290 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SSFA2P28290 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SSFA2P28290 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SSFA2P28290 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SSFA2P28290 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SSFA2P28290 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SSFA2P28290 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SSFA2P28290 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SSFA2P28290 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SSFA2P28290 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SSFA2P28290 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SSFA2P28290 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SSFA2P28290 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SSFA2P28290 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SSFA2P28290 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SSFA2P28290 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SSFA2P28290 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SSFA2P28290 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SSFA2P28290 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms