Protein–RNA interactions for Protein: P23443

RPS6KB1, Ribosomal protein S6 kinase beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB1P23443 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPS6KB1P23443 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPS6KB1P23443 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
RPS6KB1P23443 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPS6KB1P23443 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPS6KB1P23443 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPS6KB1P23443 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPS6KB1P23443 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
RPS6KB1P23443 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPS6KB1P23443 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPS6KB1P23443 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPS6KB1P23443 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPS6KB1P23443 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPS6KB1P23443 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPS6KB1P23443 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPS6KB1P23443 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPS6KB1P23443 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPS6KB1P23443 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPS6KB1P23443 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPS6KB1P23443 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPS6KB1P23443 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPS6KB1P23443 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPS6KB1P23443 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPS6KB1P23443 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPS6KB1P23443 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPS6KB1P23443 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPS6KB1P23443 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPS6KB1P23443 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPS6KB1P23443 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
RPS6KB1P23443 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPS6KB1P23443 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPS6KB1P23443 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
RPS6KB1P23443 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
RPS6KB1P23443 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPS6KB1P23443 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPS6KB1P23443 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPS6KB1P23443 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPS6KB1P23443 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPS6KB1P23443 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPS6KB1P23443 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPS6KB1P23443 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPS6KB1P23443 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPS6KB1P23443 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPS6KB1P23443 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
RPS6KB1P23443 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
RPS6KB1P23443 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
RPS6KB1P23443 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPS6KB1P23443 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPS6KB1P23443 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPS6KB1P23443 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPS6KB1P23443 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPS6KB1P23443 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPS6KB1P23443 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPS6KB1P23443 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPS6KB1P23443 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPS6KB1P23443 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPS6KB1P23443 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPS6KB1P23443 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPS6KB1P23443 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPS6KB1P23443 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPS6KB1P23443 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPS6KB1P23443 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPS6KB1P23443 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPS6KB1P23443 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPS6KB1P23443 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
RPS6KB1P23443 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPS6KB1P23443 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPS6KB1P23443 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPS6KB1P23443 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPS6KB1P23443 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPS6KB1P23443 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPS6KB1P23443 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPS6KB1P23443 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPS6KB1P23443 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPS6KB1P23443 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPS6KB1P23443 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPS6KB1P23443 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPS6KB1P23443 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPS6KB1P23443 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPS6KB1P23443 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPS6KB1P23443 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPS6KB1P23443 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPS6KB1P23443 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPS6KB1P23443 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPS6KB1P23443 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPS6KB1P23443 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPS6KB1P23443 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPS6KB1P23443 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPS6KB1P23443 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPS6KB1P23443 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPS6KB1P23443 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
RPS6KB1P23443 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPS6KB1P23443 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPS6KB1P23443 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPS6KB1P23443 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPS6KB1P23443 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPS6KB1P23443 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPS6KB1P23443 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPS6KB1P23443 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPS6KB1P23443 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms