Protein–RNA interactions for Protein: P20749

BCL3, B-cell lymphoma 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCL3P20749 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BCL3P20749 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BCL3P20749 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BCL3P20749 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BCL3P20749 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BCL3P20749 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BCL3P20749 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BCL3P20749 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BCL3P20749 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BCL3P20749 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BCL3P20749 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
BCL3P20749 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BCL3P20749 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
BCL3P20749 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BCL3P20749 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BCL3P20749 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BCL3P20749 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BCL3P20749 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
BCL3P20749 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BCL3P20749 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BCL3P20749 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BCL3P20749 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BCL3P20749 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BCL3P20749 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BCL3P20749 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BCL3P20749 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BCL3P20749 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BCL3P20749 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BCL3P20749 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BCL3P20749 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BCL3P20749 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BCL3P20749 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BCL3P20749 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BCL3P20749 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BCL3P20749 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BCL3P20749 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BCL3P20749 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BCL3P20749 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BCL3P20749 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BCL3P20749 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BCL3P20749 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
BCL3P20749 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BCL3P20749 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BCL3P20749 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BCL3P20749 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BCL3P20749 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BCL3P20749 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BCL3P20749 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BCL3P20749 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BCL3P20749 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BCL3P20749 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BCL3P20749 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BCL3P20749 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
BCL3P20749 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BCL3P20749 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
BCL3P20749 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BCL3P20749 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BCL3P20749 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
BCL3P20749 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BCL3P20749 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BCL3P20749 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
BCL3P20749 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BCL3P20749 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BCL3P20749 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BCL3P20749 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BCL3P20749 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
BCL3P20749 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BCL3P20749 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BCL3P20749 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BCL3P20749 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BCL3P20749 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BCL3P20749 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BCL3P20749 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BCL3P20749 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BCL3P20749 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BCL3P20749 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BCL3P20749 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BCL3P20749 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BCL3P20749 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BCL3P20749 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BCL3P20749 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BCL3P20749 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BCL3P20749 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BCL3P20749 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BCL3P20749 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BCL3P20749 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BCL3P20749 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BCL3P20749 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BCL3P20749 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BCL3P20749 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BCL3P20749 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BCL3P20749 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BCL3P20749 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BCL3P20749 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BCL3P20749 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BCL3P20749 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BCL3P20749 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BCL3P20749 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
BCL3P20749 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BCL3P20749 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms