Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATP4AP20648 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATP4AP20648 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATP4AP20648 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATP4AP20648 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATP4AP20648 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATP4AP20648 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATP4AP20648 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATP4AP20648 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATP4AP20648 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATP4AP20648 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATP4AP20648 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATP4AP20648 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATP4AP20648 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATP4AP20648 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATP4AP20648 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATP4AP20648 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATP4AP20648 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATP4AP20648 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATP4AP20648 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATP4AP20648 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATP4AP20648 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATP4AP20648 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATP4AP20648 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATP4AP20648 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATP4AP20648 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATP4AP20648 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATP4AP20648 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATP4AP20648 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATP4AP20648 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATP4AP20648 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATP4AP20648 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATP4AP20648 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATP4AP20648 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATP4AP20648 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATP4AP20648 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATP4AP20648 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATP4AP20648 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATP4AP20648 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATP4AP20648 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATP4AP20648 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATP4AP20648 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATP4AP20648 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
ATP4AP20648 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
ATP4AP20648 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
ATP4AP20648 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATP4AP20648 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATP4AP20648 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATP4AP20648 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATP4AP20648 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATP4AP20648 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
ATP4AP20648 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATP4AP20648 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATP4AP20648 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATP4AP20648 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATP4AP20648 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATP4AP20648 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATP4AP20648 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATP4AP20648 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
ATP4AP20648 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATP4AP20648 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATP4AP20648 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATP4AP20648 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATP4AP20648 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATP4AP20648 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATP4AP20648 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATP4AP20648 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATP4AP20648 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATP4AP20648 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATP4AP20648 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATP4AP20648 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATP4AP20648 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATP4AP20648 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATP4AP20648 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATP4AP20648 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATP4AP20648 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATP4AP20648 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATP4AP20648 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATP4AP20648 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ATP4AP20648 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATP4AP20648 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATP4AP20648 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATP4AP20648 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATP4AP20648 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATP4AP20648 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATP4AP20648 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATP4AP20648 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATP4AP20648 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATP4AP20648 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATP4AP20648 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATP4AP20648 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATP4AP20648 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATP4AP20648 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATP4AP20648 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATP4AP20648 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATP4AP20648 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ATP4AP20648 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ATP4AP20648 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATP4AP20648 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ATP4AP20648 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms