Protein–RNA interactions for Protein: P18545

PDE6G, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 87 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6GP18545 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PDE6GP18545 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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