Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
XBP1P17861 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
XBP1P17861 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
XBP1P17861 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
XBP1P17861 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
XBP1P17861 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
XBP1P17861 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
XBP1P17861 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
XBP1P17861 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
XBP1P17861 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
XBP1P17861 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
XBP1P17861 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
XBP1P17861 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
XBP1P17861 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
XBP1P17861 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
XBP1P17861 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
XBP1P17861 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
XBP1P17861 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
XBP1P17861 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
XBP1P17861 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
XBP1P17861 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
XBP1P17861 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
XBP1P17861 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
XBP1P17861 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
XBP1P17861 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
XBP1P17861 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
XBP1P17861 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
XBP1P17861 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
XBP1P17861 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
XBP1P17861 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
XBP1P17861 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
XBP1P17861 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
XBP1P17861 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
XBP1P17861 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
XBP1P17861 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
XBP1P17861 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
XBP1P17861 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
XBP1P17861 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
XBP1P17861 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
XBP1P17861 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
XBP1P17861 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
XBP1P17861 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
XBP1P17861 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
XBP1P17861 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
XBP1P17861 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
XBP1P17861 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
XBP1P17861 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
XBP1P17861 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
XBP1P17861 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
XBP1P17861 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
XBP1P17861 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
XBP1P17861 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
XBP1P17861 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
XBP1P17861 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
XBP1P17861 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
XBP1P17861 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
XBP1P17861 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
XBP1P17861 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
XBP1P17861 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
XBP1P17861 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
XBP1P17861 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
XBP1P17861 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
XBP1P17861 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
XBP1P17861 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
XBP1P17861 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
XBP1P17861 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
XBP1P17861 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
XBP1P17861 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
XBP1P17861 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
XBP1P17861 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
XBP1P17861 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
XBP1P17861 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
XBP1P17861 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
XBP1P17861 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
XBP1P17861 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
XBP1P17861 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
XBP1P17861 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
XBP1P17861 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
XBP1P17861 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
XBP1P17861 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
XBP1P17861 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
XBP1P17861 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
XBP1P17861 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
XBP1P17861 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
XBP1P17861 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
XBP1P17861 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
XBP1P17861 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
XBP1P17861 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
XBP1P17861 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
XBP1P17861 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
XBP1P17861 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
XBP1P17861 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
XBP1P17861 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
XBP1P17861 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
XBP1P17861 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
XBP1P17861 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
XBP1P17861 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
XBP1P17861 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
XBP1P17861 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
XBP1P17861 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms