Protein–RNA interactions for Protein: P13765

HLA-DOB, HLA class II histocompatibility antigen, DO beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DOBP13765 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-DOBP13765 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms