Protein–RNA interactions for Protein: P11474

ESRRA, Steroid hormone receptor ERR1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESRRAP11474 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ESRRAP11474 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ESRRAP11474 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ESRRAP11474 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ESRRAP11474 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ESRRAP11474 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ESRRAP11474 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ESRRAP11474 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ESRRAP11474 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ESRRAP11474 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ESRRAP11474 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ESRRAP11474 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ESRRAP11474 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ESRRAP11474 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ESRRAP11474 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ESRRAP11474 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ESRRAP11474 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ESRRAP11474 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ESRRAP11474 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ESRRAP11474 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ESRRAP11474 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ESRRAP11474 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ESRRAP11474 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ESRRAP11474 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ESRRAP11474 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ESRRAP11474 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ESRRAP11474 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ESRRAP11474 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ESRRAP11474 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ESRRAP11474 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ESRRAP11474 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ESRRAP11474 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ESRRAP11474 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ESRRAP11474 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ESRRAP11474 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ESRRAP11474 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ESRRAP11474 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ESRRAP11474 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ESRRAP11474 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ESRRAP11474 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ESRRAP11474 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ESRRAP11474 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ESRRAP11474 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ESRRAP11474 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ESRRAP11474 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ESRRAP11474 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ESRRAP11474 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ESRRAP11474 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ESRRAP11474 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ESRRAP11474 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ESRRAP11474 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ESRRAP11474 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ESRRAP11474 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ESRRAP11474 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ESRRAP11474 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ESRRAP11474 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ESRRAP11474 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ESRRAP11474 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ESRRAP11474 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ESRRAP11474 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ESRRAP11474 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ESRRAP11474 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ESRRAP11474 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ESRRAP11474 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ESRRAP11474 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ESRRAP11474 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ESRRAP11474 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ESRRAP11474 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ESRRAP11474 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ESRRAP11474 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ESRRAP11474 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ESRRAP11474 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ESRRAP11474 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ESRRAP11474 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ESRRAP11474 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ESRRAP11474 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ESRRAP11474 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ESRRAP11474 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ESRRAP11474 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ESRRAP11474 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ESRRAP11474 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ESRRAP11474 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ESRRAP11474 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ESRRAP11474 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ESRRAP11474 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ESRRAP11474 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ESRRAP11474 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ESRRAP11474 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ESRRAP11474 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ESRRAP11474 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ESRRAP11474 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ESRRAP11474 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ESRRAP11474 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ESRRAP11474 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ESRRAP11474 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ESRRAP11474 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ESRRAP11474 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ESRRAP11474 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ESRRAP11474 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ESRRAP11474 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms