Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GLI3P10071 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GLI3P10071 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GLI3P10071 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GLI3P10071 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
GLI3P10071 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
GLI3P10071 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GLI3P10071 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GLI3P10071 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GLI3P10071 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GLI3P10071 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GLI3P10071 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GLI3P10071 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GLI3P10071 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GLI3P10071 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GLI3P10071 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GLI3P10071 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GLI3P10071 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GLI3P10071 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GLI3P10071 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GLI3P10071 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GLI3P10071 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GLI3P10071 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GLI3P10071 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GLI3P10071 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GLI3P10071 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GLI3P10071 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GLI3P10071 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GLI3P10071 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GLI3P10071 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GLI3P10071 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GLI3P10071 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GLI3P10071 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GLI3P10071 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GLI3P10071 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GLI3P10071 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GLI3P10071 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GLI3P10071 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GLI3P10071 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GLI3P10071 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
GLI3P10071 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GLI3P10071 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GLI3P10071 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GLI3P10071 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GLI3P10071 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GLI3P10071 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GLI3P10071 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GLI3P10071 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GLI3P10071 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GLI3P10071 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GLI3P10071 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GLI3P10071 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GLI3P10071 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GLI3P10071 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GLI3P10071 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GLI3P10071 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GLI3P10071 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GLI3P10071 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GLI3P10071 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GLI3P10071 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GLI3P10071 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GLI3P10071 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GLI3P10071 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GLI3P10071 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GLI3P10071 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GLI3P10071 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GLI3P10071 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GLI3P10071 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GLI3P10071 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GLI3P10071 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GLI3P10071 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GLI3P10071 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GLI3P10071 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GLI3P10071 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GLI3P10071 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GLI3P10071 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GLI3P10071 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GLI3P10071 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GLI3P10071 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GLI3P10071 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GLI3P10071 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GLI3P10071 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GLI3P10071 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GLI3P10071 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GLI3P10071 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GLI3P10071 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GLI3P10071 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GLI3P10071 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GLI3P10071 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GLI3P10071 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GLI3P10071 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GLI3P10071 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
GLI3P10071 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
GLI3P10071 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GLI3P10071 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GLI3P10071 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GLI3P10071 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GLI3P10071 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GLI3P10071 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GLI3P10071 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms