Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM225BP0DP42 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM225BP0DP42 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms