Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

Predictions only

Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC11.43□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC11.43□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
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PKHD1P08F94 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
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