Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RHOP08100 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RHOP08100 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RHOP08100 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RHOP08100 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RHOP08100 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RHOP08100 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
RHOP08100 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RHOP08100 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RHOP08100 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RHOP08100 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RHOP08100 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RHOP08100 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RHOP08100 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RHOP08100 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RHOP08100 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RHOP08100 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RHOP08100 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RHOP08100 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RHOP08100 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RHOP08100 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RHOP08100 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RHOP08100 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RHOP08100 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RHOP08100 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RHOP08100 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RHOP08100 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RHOP08100 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RHOP08100 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RHOP08100 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RHOP08100 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RHOP08100 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RHOP08100 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RHOP08100 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RHOP08100 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RHOP08100 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RHOP08100 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RHOP08100 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RHOP08100 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RHOP08100 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RHOP08100 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RHOP08100 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RHOP08100 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RHOP08100 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RHOP08100 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RHOP08100 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RHOP08100 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RHOP08100 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RHOP08100 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RHOP08100 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RHOP08100 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RHOP08100 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RHOP08100 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RHOP08100 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RHOP08100 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RHOP08100 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RHOP08100 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RHOP08100 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RHOP08100 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RHOP08100 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RHOP08100 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RHOP08100 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RHOP08100 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RHOP08100 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RHOP08100 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RHOP08100 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RHOP08100 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RHOP08100 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RHOP08100 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RHOP08100 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RHOP08100 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RHOP08100 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RHOP08100 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RHOP08100 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RHOP08100 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RHOP08100 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RHOP08100 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RHOP08100 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RHOP08100 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RHOP08100 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RHOP08100 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RHOP08100 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RHOP08100 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RHOP08100 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RHOP08100 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RHOP08100 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RHOP08100 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RHOP08100 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RHOP08100 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RHOP08100 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RHOP08100 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RHOP08100 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RHOP08100 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RHOP08100 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RHOP08100 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RHOP08100 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RHOP08100 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RHOP08100 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RHOP08100 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RHOP08100 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms