Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CYBBP04839 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CYBBP04839 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CYBBP04839 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CYBBP04839 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CYBBP04839 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CYBBP04839 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CYBBP04839 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CYBBP04839 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CYBBP04839 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CYBBP04839 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CYBBP04839 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CYBBP04839 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CYBBP04839 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CYBBP04839 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CYBBP04839 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CYBBP04839 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CYBBP04839 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CYBBP04839 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CYBBP04839 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CYBBP04839 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CYBBP04839 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CYBBP04839 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CYBBP04839 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CYBBP04839 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CYBBP04839 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CYBBP04839 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CYBBP04839 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CYBBP04839 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CYBBP04839 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CYBBP04839 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CYBBP04839 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CYBBP04839 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CYBBP04839 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
CYBBP04839 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CYBBP04839 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CYBBP04839 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CYBBP04839 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CYBBP04839 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CYBBP04839 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CYBBP04839 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CYBBP04839 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CYBBP04839 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CYBBP04839 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CYBBP04839 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CYBBP04839 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CYBBP04839 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CYBBP04839 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CYBBP04839 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CYBBP04839 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CYBBP04839 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CYBBP04839 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CYBBP04839 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CYBBP04839 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CYBBP04839 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CYBBP04839 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CYBBP04839 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CYBBP04839 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CYBBP04839 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CYBBP04839 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CYBBP04839 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CYBBP04839 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CYBBP04839 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CYBBP04839 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CYBBP04839 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CYBBP04839 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CYBBP04839 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CYBBP04839 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CYBBP04839 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CYBBP04839 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CYBBP04839 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CYBBP04839 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CYBBP04839 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CYBBP04839 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CYBBP04839 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CYBBP04839 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CYBBP04839 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CYBBP04839 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CYBBP04839 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CYBBP04839 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CYBBP04839 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CYBBP04839 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CYBBP04839 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CYBBP04839 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CYBBP04839 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CYBBP04839 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CYBBP04839 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CYBBP04839 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CYBBP04839 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CYBBP04839 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CYBBP04839 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CYBBP04839 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CYBBP04839 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CYBBP04839 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CYBBP04839 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CYBBP04839 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CYBBP04839 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CYBBP04839 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYBBP04839 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYBBP04839 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms