Protein–RNA interactions for Protein: O95926

SYF2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2O95926 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYF2O95926 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYF2O95926 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYF2O95926 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYF2O95926 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYF2O95926 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
SYF2O95926 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYF2O95926 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYF2O95926 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYF2O95926 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYF2O95926 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYF2O95926 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYF2O95926 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYF2O95926 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYF2O95926 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYF2O95926 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SYF2O95926 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYF2O95926 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYF2O95926 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYF2O95926 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYF2O95926 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYF2O95926 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYF2O95926 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYF2O95926 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYF2O95926 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYF2O95926 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYF2O95926 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYF2O95926 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYF2O95926 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SYF2O95926 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYF2O95926 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYF2O95926 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYF2O95926 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYF2O95926 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYF2O95926 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYF2O95926 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYF2O95926 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SYF2O95926 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SYF2O95926 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYF2O95926 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYF2O95926 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYF2O95926 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYF2O95926 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYF2O95926 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYF2O95926 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYF2O95926 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYF2O95926 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYF2O95926 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYF2O95926 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYF2O95926 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SYF2O95926 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYF2O95926 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYF2O95926 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYF2O95926 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYF2O95926 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYF2O95926 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYF2O95926 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYF2O95926 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYF2O95926 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYF2O95926 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYF2O95926 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYF2O95926 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYF2O95926 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYF2O95926 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYF2O95926 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYF2O95926 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYF2O95926 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYF2O95926 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYF2O95926 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYF2O95926 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYF2O95926 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYF2O95926 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYF2O95926 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYF2O95926 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SYF2O95926 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYF2O95926 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYF2O95926 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYF2O95926 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYF2O95926 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYF2O95926 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYF2O95926 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYF2O95926 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYF2O95926 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYF2O95926 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYF2O95926 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYF2O95926 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYF2O95926 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYF2O95926 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYF2O95926 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYF2O95926 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYF2O95926 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYF2O95926 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYF2O95926 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYF2O95926 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYF2O95926 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SYF2O95926 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SYF2O95926 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SYF2O95926 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SYF2O95926 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SYF2O95926 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms