Protein–RNA interactions for Protein: O95873

C6orf47, Uncharacterized protein C6orf47, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf47O95873 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C6orf47O95873 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C6orf47O95873 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17■□□□□ 0.31
C6orf47O95873 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C6orf47O95873 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C6orf47O95873 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
C6orf47O95873 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C6orf47O95873 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
C6orf47O95873 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
C6orf47O95873 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
C6orf47O95873 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C6orf47O95873 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C6orf47O95873 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C6orf47O95873 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
C6orf47O95873 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
C6orf47O95873 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C6orf47O95873 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
C6orf47O95873 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C6orf47O95873 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17■□□□□ 0.31
C6orf47O95873 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
C6orf47O95873 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C6orf47O95873 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C6orf47O95873 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C6orf47O95873 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C6orf47O95873 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C6orf47O95873 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C6orf47O95873 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C6orf47O95873 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C6orf47O95873 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C6orf47O95873 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C6orf47O95873 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C6orf47O95873 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C6orf47O95873 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C6orf47O95873 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C6orf47O95873 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
C6orf47O95873 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C6orf47O95873 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C6orf47O95873 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C6orf47O95873 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C6orf47O95873 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C6orf47O95873 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C6orf47O95873 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C6orf47O95873 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C6orf47O95873 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C6orf47O95873 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C6orf47O95873 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C6orf47O95873 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C6orf47O95873 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C6orf47O95873 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C6orf47O95873 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C6orf47O95873 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C6orf47O95873 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C6orf47O95873 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C6orf47O95873 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C6orf47O95873 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C6orf47O95873 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C6orf47O95873 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C6orf47O95873 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C6orf47O95873 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C6orf47O95873 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C6orf47O95873 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C6orf47O95873 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C6orf47O95873 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C6orf47O95873 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C6orf47O95873 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C6orf47O95873 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C6orf47O95873 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C6orf47O95873 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C6orf47O95873 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C6orf47O95873 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C6orf47O95873 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C6orf47O95873 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C6orf47O95873 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C6orf47O95873 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C6orf47O95873 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C6orf47O95873 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C6orf47O95873 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C6orf47O95873 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C6orf47O95873 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C6orf47O95873 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C6orf47O95873 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C6orf47O95873 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C6orf47O95873 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C6orf47O95873 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C6orf47O95873 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C6orf47O95873 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C6orf47O95873 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C6orf47O95873 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C6orf47O95873 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C6orf47O95873 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
C6orf47O95873 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
C6orf47O95873 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C6orf47O95873 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C6orf47O95873 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C6orf47O95873 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C6orf47O95873 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C6orf47O95873 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C6orf47O95873 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C6orf47O95873 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C6orf47O95873 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms