Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F6O75461 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F6O75461 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F6O75461 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F6O75461 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F6O75461 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F6O75461 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F6O75461 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F6O75461 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F6O75461 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F6O75461 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F6O75461 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F6O75461 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F6O75461 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F6O75461 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F6O75461 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F6O75461 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F6O75461 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F6O75461 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F6O75461 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F6O75461 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F6O75461 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F6O75461 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F6O75461 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F6O75461 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F6O75461 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F6O75461 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F6O75461 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F6O75461 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F6O75461 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F6O75461 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F6O75461 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F6O75461 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F6O75461 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F6O75461 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F6O75461 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F6O75461 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F6O75461 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F6O75461 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F6O75461 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F6O75461 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F6O75461 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F6O75461 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F6O75461 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F6O75461 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F6O75461 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F6O75461 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F6O75461 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F6O75461 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F6O75461 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F6O75461 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F6O75461 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F6O75461 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F6O75461 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F6O75461 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F6O75461 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F6O75461 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F6O75461 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F6O75461 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F6O75461 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F6O75461 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F6O75461 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F6O75461 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F6O75461 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2F6O75461 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2F6O75461 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2F6O75461 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2F6O75461 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2F6O75461 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2F6O75461 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2F6O75461 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2F6O75461 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2F6O75461 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2F6O75461 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2F6O75461 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2F6O75461 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2F6O75461 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2F6O75461 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2F6O75461 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2F6O75461 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2F6O75461 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2F6O75461 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2F6O75461 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2F6O75461 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2F6O75461 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2F6O75461 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2F6O75461 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2F6O75461 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2F6O75461 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2F6O75461 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2F6O75461 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2F6O75461 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2F6O75461 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2F6O75461 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2F6O75461 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2F6O75461 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2F6O75461 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2F6O75461 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2F6O75461 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2F6O75461 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms