Protein–RNA interactions for Protein: O60931

CTNS, Cystinosin, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNSO60931 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTNSO60931 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNSO60931 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNSO60931 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNSO60931 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNSO60931 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNSO60931 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNSO60931 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNSO60931 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNSO60931 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNSO60931 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNSO60931 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNSO60931 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNSO60931 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNSO60931 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNSO60931 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNSO60931 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNSO60931 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNSO60931 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNSO60931 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNSO60931 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNSO60931 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNSO60931 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNSO60931 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNSO60931 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNSO60931 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNSO60931 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNSO60931 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNSO60931 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNSO60931 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNSO60931 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNSO60931 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNSO60931 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNSO60931 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNSO60931 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNSO60931 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNSO60931 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNSO60931 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNSO60931 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNSO60931 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNSO60931 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNSO60931 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNSO60931 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNSO60931 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CTNSO60931 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CTNSO60931 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CTNSO60931 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CTNSO60931 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CTNSO60931 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CTNSO60931 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CTNSO60931 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTNSO60931 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTNSO60931 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTNSO60931 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTNSO60931 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTNSO60931 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTNSO60931 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTNSO60931 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTNSO60931 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTNSO60931 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTNSO60931 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTNSO60931 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTNSO60931 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTNSO60931 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTNSO60931 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTNSO60931 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTNSO60931 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTNSO60931 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTNSO60931 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CTNSO60931 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTNSO60931 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTNSO60931 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTNSO60931 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTNSO60931 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTNSO60931 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTNSO60931 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTNSO60931 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTNSO60931 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTNSO60931 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTNSO60931 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTNSO60931 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTNSO60931 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTNSO60931 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTNSO60931 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTNSO60931 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTNSO60931 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTNSO60931 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTNSO60931 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTNSO60931 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTNSO60931 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTNSO60931 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTNSO60931 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTNSO60931 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTNSO60931 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTNSO60931 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTNSO60931 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTNSO60931 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTNSO60931 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTNSO60931 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CTNSO60931 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms