Protein–RNA interactions for Protein: O60264

SMARCA5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA5O60264 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMARCA5O60264 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMARCA5O60264 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMARCA5O60264 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMARCA5O60264 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMARCA5O60264 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMARCA5O60264 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMARCA5O60264 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMARCA5O60264 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMARCA5O60264 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SMARCA5O60264 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SMARCA5O60264 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMARCA5O60264 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SMARCA5O60264 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMARCA5O60264 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMARCA5O60264 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMARCA5O60264 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMARCA5O60264 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMARCA5O60264 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMARCA5O60264 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMARCA5O60264 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMARCA5O60264 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMARCA5O60264 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMARCA5O60264 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SMARCA5O60264 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMARCA5O60264 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMARCA5O60264 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SMARCA5O60264 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMARCA5O60264 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMARCA5O60264 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMARCA5O60264 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMARCA5O60264 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMARCA5O60264 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMARCA5O60264 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMARCA5O60264 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMARCA5O60264 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMARCA5O60264 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMARCA5O60264 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMARCA5O60264 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMARCA5O60264 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMARCA5O60264 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMARCA5O60264 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMARCA5O60264 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMARCA5O60264 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMARCA5O60264 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMARCA5O60264 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMARCA5O60264 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMARCA5O60264 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMARCA5O60264 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMARCA5O60264 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SMARCA5O60264 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMARCA5O60264 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMARCA5O60264 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMARCA5O60264 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMARCA5O60264 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMARCA5O60264 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMARCA5O60264 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMARCA5O60264 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMARCA5O60264 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMARCA5O60264 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMARCA5O60264 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMARCA5O60264 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMARCA5O60264 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMARCA5O60264 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMARCA5O60264 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMARCA5O60264 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMARCA5O60264 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMARCA5O60264 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMARCA5O60264 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMARCA5O60264 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMARCA5O60264 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMARCA5O60264 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMARCA5O60264 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMARCA5O60264 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMARCA5O60264 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SMARCA5O60264 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SMARCA5O60264 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMARCA5O60264 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMARCA5O60264 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMARCA5O60264 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMARCA5O60264 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMARCA5O60264 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMARCA5O60264 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMARCA5O60264 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMARCA5O60264 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMARCA5O60264 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMARCA5O60264 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMARCA5O60264 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMARCA5O60264 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMARCA5O60264 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMARCA5O60264 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMARCA5O60264 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SMARCA5O60264 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMARCA5O60264 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMARCA5O60264 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMARCA5O60264 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMARCA5O60264 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMARCA5O60264 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMARCA5O60264 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SMARCA5O60264 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms