Protein–RNA interactions for Protein: O43921

EFNA2, Ephrin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA2O43921 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNA2O43921 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms