Protein–RNA interactions for Protein: O43464

HTRA2, Serine protease HTRA2, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA2O43464 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HTRA2O43464 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms