Protein–RNA interactions for Protein: O43248

HOXC11, Homeobox protein Hox-C11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC11O43248 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXC11O43248 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXC11O43248 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXC11O43248 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXC11O43248 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXC11O43248 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXC11O43248 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXC11O43248 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXC11O43248 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXC11O43248 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXC11O43248 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXC11O43248 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXC11O43248 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXC11O43248 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXC11O43248 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXC11O43248 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXC11O43248 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXC11O43248 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXC11O43248 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXC11O43248 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXC11O43248 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXC11O43248 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXC11O43248 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXC11O43248 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXC11O43248 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXC11O43248 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXC11O43248 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXC11O43248 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXC11O43248 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXC11O43248 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXC11O43248 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXC11O43248 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXC11O43248 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXC11O43248 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXC11O43248 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXC11O43248 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXC11O43248 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXC11O43248 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXC11O43248 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXC11O43248 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXC11O43248 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXC11O43248 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXC11O43248 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXC11O43248 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXC11O43248 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXC11O43248 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXC11O43248 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXC11O43248 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXC11O43248 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXC11O43248 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXC11O43248 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXC11O43248 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXC11O43248 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXC11O43248 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXC11O43248 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXC11O43248 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXC11O43248 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXC11O43248 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXC11O43248 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXC11O43248 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXC11O43248 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXC11O43248 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXC11O43248 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXC11O43248 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXC11O43248 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXC11O43248 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXC11O43248 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXC11O43248 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXC11O43248 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXC11O43248 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXC11O43248 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXC11O43248 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXC11O43248 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXC11O43248 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXC11O43248 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXC11O43248 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXC11O43248 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXC11O43248 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXC11O43248 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXC11O43248 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXC11O43248 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXC11O43248 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXC11O43248 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXC11O43248 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXC11O43248 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXC11O43248 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXC11O43248 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXC11O43248 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXC11O43248 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXC11O43248 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXC11O43248 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXC11O43248 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXC11O43248 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXC11O43248 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXC11O43248 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXC11O43248 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXC11O43248 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXC11O43248 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXC11O43248 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXC11O43248 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms