Protein–RNA interactions for Protein: O43189

PHF1, PHD finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF1O43189 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHF1O43189 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHF1O43189 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHF1O43189 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHF1O43189 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHF1O43189 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHF1O43189 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHF1O43189 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHF1O43189 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHF1O43189 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PHF1O43189 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHF1O43189 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHF1O43189 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHF1O43189 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHF1O43189 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHF1O43189 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHF1O43189 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHF1O43189 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHF1O43189 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHF1O43189 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHF1O43189 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHF1O43189 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHF1O43189 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHF1O43189 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHF1O43189 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHF1O43189 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHF1O43189 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHF1O43189 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHF1O43189 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHF1O43189 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PHF1O43189 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHF1O43189 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHF1O43189 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHF1O43189 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHF1O43189 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHF1O43189 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PHF1O43189 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHF1O43189 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PHF1O43189 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PHF1O43189 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHF1O43189 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHF1O43189 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHF1O43189 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHF1O43189 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHF1O43189 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHF1O43189 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHF1O43189 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHF1O43189 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHF1O43189 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHF1O43189 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHF1O43189 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHF1O43189 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHF1O43189 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHF1O43189 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHF1O43189 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHF1O43189 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHF1O43189 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHF1O43189 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHF1O43189 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHF1O43189 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHF1O43189 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHF1O43189 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHF1O43189 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHF1O43189 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHF1O43189 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHF1O43189 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHF1O43189 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PHF1O43189 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHF1O43189 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHF1O43189 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHF1O43189 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHF1O43189 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHF1O43189 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHF1O43189 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PHF1O43189 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHF1O43189 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHF1O43189 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHF1O43189 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHF1O43189 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHF1O43189 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHF1O43189 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHF1O43189 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHF1O43189 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PHF1O43189 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHF1O43189 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PHF1O43189 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHF1O43189 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHF1O43189 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHF1O43189 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHF1O43189 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHF1O43189 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHF1O43189 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHF1O43189 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHF1O43189 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHF1O43189 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHF1O43189 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHF1O43189 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PHF1O43189 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHF1O43189 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHF1O43189 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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