Protein–RNA interactions for Protein: O15143

ARPC1B, Actin-related protein 2/3 complex subunit 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC1BO15143 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARPC1BO15143 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
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