Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYNMO15061 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYNMO15061 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SYNMO15061 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYNMO15061 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYNMO15061 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYNMO15061 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYNMO15061 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYNMO15061 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYNMO15061 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYNMO15061 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYNMO15061 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYNMO15061 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYNMO15061 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYNMO15061 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYNMO15061 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYNMO15061 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SYNMO15061 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYNMO15061 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SYNMO15061 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYNMO15061 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SYNMO15061 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SYNMO15061 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYNMO15061 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYNMO15061 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYNMO15061 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYNMO15061 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYNMO15061 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYNMO15061 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYNMO15061 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYNMO15061 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYNMO15061 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SYNMO15061 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYNMO15061 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYNMO15061 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYNMO15061 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYNMO15061 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYNMO15061 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYNMO15061 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYNMO15061 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYNMO15061 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYNMO15061 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYNMO15061 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYNMO15061 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SYNMO15061 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYNMO15061 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYNMO15061 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYNMO15061 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SYNMO15061 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYNMO15061 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYNMO15061 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYNMO15061 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYNMO15061 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYNMO15061 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYNMO15061 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYNMO15061 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYNMO15061 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SYNMO15061 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SYNMO15061 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SYNMO15061 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SYNMO15061 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
SYNMO15061 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
SYNMO15061 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SYNMO15061 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SYNMO15061 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SYNMO15061 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SYNMO15061 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SYNMO15061 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SYNMO15061 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SYNMO15061 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SYNMO15061 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SYNMO15061 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SYNMO15061 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SYNMO15061 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SYNMO15061 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SYNMO15061 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SYNMO15061 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SYNMO15061 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SYNMO15061 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SYNMO15061 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SYNMO15061 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SYNMO15061 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SYNMO15061 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SYNMO15061 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SYNMO15061 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SYNMO15061 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SYNMO15061 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SYNMO15061 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SYNMO15061 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SYNMO15061 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SYNMO15061 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SYNMO15061 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SYNMO15061 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SYNMO15061 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SYNMO15061 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SYNMO15061 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SYNMO15061 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SYNMO15061 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SYNMO15061 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SYNMO15061 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms