Protein–RNA interactions for Protein: O15054

KDM6B, Lysine-specific demethylase 6B, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6BO15054 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KDM6BO15054 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
KDM6BO15054 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
KDM6BO15054 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KDM6BO15054 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KDM6BO15054 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KDM6BO15054 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KDM6BO15054 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC27.56■■■□□ 2
KDM6BO15054 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC27.56■■■□□ 2
KDM6BO15054 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC27.56■■■□□ 2
KDM6BO15054 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
KDM6BO15054 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
KDM6BO15054 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KDM6BO15054 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
KDM6BO15054 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KDM6BO15054 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KDM6BO15054 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KDM6BO15054 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
KDM6BO15054 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
KDM6BO15054 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
KDM6BO15054 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
KDM6BO15054 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
KDM6BO15054 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KDM6BO15054 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KDM6BO15054 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KDM6BO15054 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
KDM6BO15054 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KDM6BO15054 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
KDM6BO15054 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
KDM6BO15054 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
KDM6BO15054 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
KDM6BO15054 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KDM6BO15054 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC27.54■■■□□ 2
KDM6BO15054 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KDM6BO15054 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
KDM6BO15054 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
KDM6BO15054 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
KDM6BO15054 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
KDM6BO15054 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KDM6BO15054 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
KDM6BO15054 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KDM6BO15054 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KDM6BO15054 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KDM6BO15054 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KDM6BO15054 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KDM6BO15054 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
KDM6BO15054 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KDM6BO15054 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC27.53■■■□□ 2
KDM6BO15054 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
KDM6BO15054 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KDM6BO15054 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
KDM6BO15054 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
KDM6BO15054 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC27.52■■■□□ 2
KDM6BO15054 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KDM6BO15054 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KDM6BO15054 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC27.52■■■□□ 2
KDM6BO15054 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
KDM6BO15054 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KDM6BO15054 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
KDM6BO15054 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
KDM6BO15054 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.52■■■□□ 2
KDM6BO15054 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
KDM6BO15054 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
KDM6BO15054 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
KDM6BO15054 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
KDM6BO15054 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KDM6BO15054 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KDM6BO15054 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KDM6BO15054 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KDM6BO15054 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KDM6BO15054 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KDM6BO15054 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KDM6BO15054 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KDM6BO15054 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
KDM6BO15054 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KDM6BO15054 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KDM6BO15054 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KDM6BO15054 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KDM6BO15054 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KDM6BO15054 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KDM6BO15054 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
KDM6BO15054 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KDM6BO15054 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KDM6BO15054 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KDM6BO15054 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
KDM6BO15054 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KDM6BO15054 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
KDM6BO15054 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KDM6BO15054 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KDM6BO15054 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KDM6BO15054 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KDM6BO15054 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KDM6BO15054 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
KDM6BO15054 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
KDM6BO15054 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KDM6BO15054 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KDM6BO15054 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KDM6BO15054 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KDM6BO15054 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KDM6BO15054 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms