Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CLGNO14967 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLGNO14967 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLGNO14967 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLGNO14967 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLGNO14967 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLGNO14967 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CLGNO14967 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLGNO14967 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLGNO14967 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLGNO14967 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLGNO14967 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLGNO14967 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLGNO14967 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLGNO14967 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLGNO14967 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLGNO14967 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLGNO14967 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLGNO14967 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLGNO14967 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLGNO14967 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLGNO14967 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLGNO14967 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLGNO14967 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLGNO14967 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLGNO14967 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLGNO14967 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CLGNO14967 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLGNO14967 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLGNO14967 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLGNO14967 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLGNO14967 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLGNO14967 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLGNO14967 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLGNO14967 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLGNO14967 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLGNO14967 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLGNO14967 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLGNO14967 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLGNO14967 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLGNO14967 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLGNO14967 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLGNO14967 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLGNO14967 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLGNO14967 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLGNO14967 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLGNO14967 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CLGNO14967 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLGNO14967 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLGNO14967 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLGNO14967 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLGNO14967 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLGNO14967 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLGNO14967 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CLGNO14967 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLGNO14967 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CLGNO14967 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CLGNO14967 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLGNO14967 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLGNO14967 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLGNO14967 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLGNO14967 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLGNO14967 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLGNO14967 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLGNO14967 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLGNO14967 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLGNO14967 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLGNO14967 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLGNO14967 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLGNO14967 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLGNO14967 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLGNO14967 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLGNO14967 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLGNO14967 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLGNO14967 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLGNO14967 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLGNO14967 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLGNO14967 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLGNO14967 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLGNO14967 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLGNO14967 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLGNO14967 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLGNO14967 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLGNO14967 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLGNO14967 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLGNO14967 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLGNO14967 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLGNO14967 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLGNO14967 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLGNO14967 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLGNO14967 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLGNO14967 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLGNO14967 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLGNO14967 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLGNO14967 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLGNO14967 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLGNO14967 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLGNO14967 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLGNO14967 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLGNO14967 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms