Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRTO14522 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRTO14522 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRTO14522 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRTO14522 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRTO14522 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRTO14522 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRTO14522 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRTO14522 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRTO14522 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRTO14522 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRTO14522 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRTO14522 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPRTO14522 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPRTO14522 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPRTO14522 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPRTO14522 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPRTO14522 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPRTO14522 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPRTO14522 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPRTO14522 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPRTO14522 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPRTO14522 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPRTO14522 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPRTO14522 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPRTO14522 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPRTO14522 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPRTO14522 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPRTO14522 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPRTO14522 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPRTO14522 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPRTO14522 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPRTO14522 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPRTO14522 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPRTO14522 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPRTO14522 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPRTO14522 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPRTO14522 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPRTO14522 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPRTO14522 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPRTO14522 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPRTO14522 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPRTO14522 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPRTO14522 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPRTO14522 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPRTO14522 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPRTO14522 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPRTO14522 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPRTO14522 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPRTO14522 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPRTO14522 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPRTO14522 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPRTO14522 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.76
PTPRTO14522 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.76
PTPRTO14522 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPRTO14522 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPRTO14522 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPRTO14522 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPRTO14522 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPRTO14522 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPRTO14522 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPRTO14522 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPRTO14522 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPRTO14522 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPRTO14522 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPRTO14522 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPRTO14522 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPRTO14522 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPRTO14522 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPRTO14522 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPRTO14522 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PTPRTO14522 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PTPRTO14522 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PTPRTO14522 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PTPRTO14522 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PTPRTO14522 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PTPRTO14522 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PTPRTO14522 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PTPRTO14522 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PTPRTO14522 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PTPRTO14522 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PTPRTO14522 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PTPRTO14522 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PTPRTO14522 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PTPRTO14522 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PTPRTO14522 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PTPRTO14522 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PTPRTO14522 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPRTO14522 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPRTO14522 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPRTO14522 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPRTO14522 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPRTO14522 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPRTO14522 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPRTO14522 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPRTO14522 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPRTO14522 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPRTO14522 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPRTO14522 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPRTO14522 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
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