Protein–RNA interactions for Protein: O00273

DFFA, DNA fragmentation factor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DFFAO00273 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DFFAO00273 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DFFAO00273 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DFFAO00273 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DFFAO00273 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DFFAO00273 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DFFAO00273 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
DFFAO00273 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DFFAO00273 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DFFAO00273 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DFFAO00273 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DFFAO00273 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DFFAO00273 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DFFAO00273 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DFFAO00273 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DFFAO00273 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DFFAO00273 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DFFAO00273 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DFFAO00273 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DFFAO00273 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DFFAO00273 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DFFAO00273 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DFFAO00273 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DFFAO00273 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DFFAO00273 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DFFAO00273 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DFFAO00273 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DFFAO00273 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DFFAO00273 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DFFAO00273 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DFFAO00273 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DFFAO00273 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DFFAO00273 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DFFAO00273 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DFFAO00273 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DFFAO00273 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DFFAO00273 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DFFAO00273 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DFFAO00273 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
DFFAO00273 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DFFAO00273 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DFFAO00273 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DFFAO00273 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DFFAO00273 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DFFAO00273 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DFFAO00273 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DFFAO00273 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DFFAO00273 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DFFAO00273 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DFFAO00273 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DFFAO00273 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DFFAO00273 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DFFAO00273 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DFFAO00273 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DFFAO00273 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DFFAO00273 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DFFAO00273 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DFFAO00273 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DFFAO00273 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DFFAO00273 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DFFAO00273 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DFFAO00273 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DFFAO00273 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DFFAO00273 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DFFAO00273 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DFFAO00273 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DFFAO00273 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DFFAO00273 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DFFAO00273 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DFFAO00273 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DFFAO00273 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DFFAO00273 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
DFFAO00273 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DFFAO00273 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
DFFAO00273 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DFFAO00273 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DFFAO00273 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DFFAO00273 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DFFAO00273 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DFFAO00273 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DFFAO00273 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DFFAO00273 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DFFAO00273 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DFFAO00273 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DFFAO00273 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DFFAO00273 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DFFAO00273 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DFFAO00273 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DFFAO00273 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DFFAO00273 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DFFAO00273 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DFFAO00273 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DFFAO00273 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DFFAO00273 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DFFAO00273 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DFFAO00273 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
DFFAO00273 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DFFAO00273 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DFFAO00273 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DFFAO00273 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms