Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms