Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms