Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN25C9JDP6 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms