Protein–RNA interactions for Protein: A8MVJ9

Putative histone PARylation factor 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A8MVJ9 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
A8MVJ9 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
A8MVJ9 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
A8MVJ9 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
A8MVJ9 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
A8MVJ9 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
A8MVJ9 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
A8MVJ9 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
A8MVJ9 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
A8MVJ9 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
A8MVJ9 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
A8MVJ9 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
A8MVJ9 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17■□□□□ 0.31
A8MVJ9 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
A8MVJ9 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
A8MVJ9 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
A8MVJ9 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
A8MVJ9 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
A8MVJ9 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC17■□□□□ 0.31
A8MVJ9 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17■□□□□ 0.31
A8MVJ9 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
A8MVJ9 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
A8MVJ9 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
A8MVJ9 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
A8MVJ9 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
A8MVJ9 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17■□□□□ 0.31
A8MVJ9 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
A8MVJ9 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
A8MVJ9 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17■□□□□ 0.31
A8MVJ9 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
A8MVJ9 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
A8MVJ9 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
A8MVJ9 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
A8MVJ9 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
A8MVJ9 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
A8MVJ9 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
A8MVJ9 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
A8MVJ9 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
A8MVJ9 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
A8MVJ9 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
A8MVJ9 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
A8MVJ9 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
A8MVJ9 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
A8MVJ9 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
A8MVJ9 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
A8MVJ9 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
A8MVJ9 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
A8MVJ9 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
A8MVJ9 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
A8MVJ9 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
A8MVJ9 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
A8MVJ9 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
A8MVJ9 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
A8MVJ9 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
A8MVJ9 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
A8MVJ9 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
A8MVJ9 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
A8MVJ9 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
A8MVJ9 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
A8MVJ9 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
A8MVJ9 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
A8MVJ9 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
A8MVJ9 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
A8MVJ9 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
A8MVJ9 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
A8MVJ9 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
A8MVJ9 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
A8MVJ9 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
A8MVJ9 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
A8MVJ9 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
A8MVJ9 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
A8MVJ9 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
A8MVJ9 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
A8MVJ9 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
A8MVJ9 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
A8MVJ9 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
A8MVJ9 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
A8MVJ9 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
A8MVJ9 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
A8MVJ9 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
A8MVJ9 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
A8MVJ9 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
A8MVJ9 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
A8MVJ9 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
A8MVJ9 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
A8MVJ9 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
A8MVJ9 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
A8MVJ9 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
A8MVJ9 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
A8MVJ9 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
A8MVJ9 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
A8MVJ9 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
A8MVJ9 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
A8MVJ9 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
A8MVJ9 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
A8MVJ9 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
A8MVJ9 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
A8MVJ9 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
A8MVJ9 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
A8MVJ9 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms