Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NOTOA8MTQ0 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NOTOA8MTQ0 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NOTOA8MTQ0 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NOTOA8MTQ0 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NOTOA8MTQ0 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NOTOA8MTQ0 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NOTOA8MTQ0 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NOTOA8MTQ0 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NOTOA8MTQ0 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NOTOA8MTQ0 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NOTOA8MTQ0 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NOTOA8MTQ0 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NOTOA8MTQ0 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NOTOA8MTQ0 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NOTOA8MTQ0 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NOTOA8MTQ0 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NOTOA8MTQ0 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NOTOA8MTQ0 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NOTOA8MTQ0 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NOTOA8MTQ0 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NOTOA8MTQ0 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NOTOA8MTQ0 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NOTOA8MTQ0 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NOTOA8MTQ0 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NOTOA8MTQ0 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NOTOA8MTQ0 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NOTOA8MTQ0 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NOTOA8MTQ0 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NOTOA8MTQ0 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NOTOA8MTQ0 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NOTOA8MTQ0 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NOTOA8MTQ0 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NOTOA8MTQ0 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NOTOA8MTQ0 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NOTOA8MTQ0 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NOTOA8MTQ0 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NOTOA8MTQ0 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NOTOA8MTQ0 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NOTOA8MTQ0 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NOTOA8MTQ0 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NOTOA8MTQ0 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NOTOA8MTQ0 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NOTOA8MTQ0 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NOTOA8MTQ0 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NOTOA8MTQ0 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NOTOA8MTQ0 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NOTOA8MTQ0 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NOTOA8MTQ0 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NOTOA8MTQ0 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms