Protein–RNA interactions for Protein: A4FU69

EFCAB5, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB5A4FU69 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
EFCAB5A4FU69 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
EFCAB5A4FU69 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
EFCAB5A4FU69 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
EFCAB5A4FU69 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
EFCAB5A4FU69 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.08
EFCAB5A4FU69 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
EFCAB5A4FU69 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.08
EFCAB5A4FU69 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.08
EFCAB5A4FU69 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.08
EFCAB5A4FU69 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
EFCAB5A4FU69 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
EFCAB5A4FU69 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
EFCAB5A4FU69 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
EFCAB5A4FU69 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
EFCAB5A4FU69 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
EFCAB5A4FU69 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
EFCAB5A4FU69 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
EFCAB5A4FU69 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
EFCAB5A4FU69 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
EFCAB5A4FU69 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
EFCAB5A4FU69 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
EFCAB5A4FU69 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
EFCAB5A4FU69 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
EFCAB5A4FU69 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
EFCAB5A4FU69 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
EFCAB5A4FU69 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
EFCAB5A4FU69 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
EFCAB5A4FU69 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
EFCAB5A4FU69 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
EFCAB5A4FU69 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
EFCAB5A4FU69 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
EFCAB5A4FU69 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
EFCAB5A4FU69 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
EFCAB5A4FU69 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
EFCAB5A4FU69 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
EFCAB5A4FU69 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
EFCAB5A4FU69 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
EFCAB5A4FU69 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
EFCAB5A4FU69 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
EFCAB5A4FU69 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
EFCAB5A4FU69 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
EFCAB5A4FU69 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
EFCAB5A4FU69 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
EFCAB5A4FU69 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
EFCAB5A4FU69 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
EFCAB5A4FU69 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
EFCAB5A4FU69 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
EFCAB5A4FU69 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
EFCAB5A4FU69 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
EFCAB5A4FU69 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
EFCAB5A4FU69 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
EFCAB5A4FU69 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
EFCAB5A4FU69 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
EFCAB5A4FU69 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
EFCAB5A4FU69 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
EFCAB5A4FU69 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
EFCAB5A4FU69 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
EFCAB5A4FU69 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
EFCAB5A4FU69 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
EFCAB5A4FU69 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
EFCAB5A4FU69 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
EFCAB5A4FU69 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
EFCAB5A4FU69 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
EFCAB5A4FU69 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
EFCAB5A4FU69 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
EFCAB5A4FU69 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
EFCAB5A4FU69 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
EFCAB5A4FU69 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
EFCAB5A4FU69 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
EFCAB5A4FU69 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
EFCAB5A4FU69 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
EFCAB5A4FU69 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
EFCAB5A4FU69 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
EFCAB5A4FU69 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
EFCAB5A4FU69 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
EFCAB5A4FU69 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
EFCAB5A4FU69 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
EFCAB5A4FU69 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
EFCAB5A4FU69 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
EFCAB5A4FU69 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
EFCAB5A4FU69 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
EFCAB5A4FU69 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
EFCAB5A4FU69 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
EFCAB5A4FU69 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
EFCAB5A4FU69 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
EFCAB5A4FU69 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
EFCAB5A4FU69 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
EFCAB5A4FU69 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
EFCAB5A4FU69 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
EFCAB5A4FU69 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
EFCAB5A4FU69 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
EFCAB5A4FU69 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
EFCAB5A4FU69 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
EFCAB5A4FU69 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
EFCAB5A4FU69 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
EFCAB5A4FU69 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
EFCAB5A4FU69 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
EFCAB5A4FU69 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
EFCAB5A4FU69 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms