Protein–RNA interactions for Protein: A2RUR9

CCDC144A, Coiled-coil domain-containing protein 144A, humanhuman

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144AA2RUR9 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC144AA2RUR9 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC144AA2RUR9 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC144AA2RUR9 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC144AA2RUR9 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC144AA2RUR9 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC144AA2RUR9 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC144AA2RUR9 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC144AA2RUR9 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC144AA2RUR9 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC144AA2RUR9 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC144AA2RUR9 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC144AA2RUR9 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC144AA2RUR9 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC144AA2RUR9 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC144AA2RUR9 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC144AA2RUR9 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC144AA2RUR9 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC144AA2RUR9 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC144AA2RUR9 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC144AA2RUR9 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC144AA2RUR9 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC144AA2RUR9 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCDC144AA2RUR9 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCDC144AA2RUR9 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC144AA2RUR9 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC144AA2RUR9 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC144AA2RUR9 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC144AA2RUR9 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC144AA2RUR9 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC144AA2RUR9 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC144AA2RUR9 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC144AA2RUR9 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC144AA2RUR9 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC144AA2RUR9 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC144AA2RUR9 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC144AA2RUR9 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC144AA2RUR9 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC144AA2RUR9 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC144AA2RUR9 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC144AA2RUR9 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC144AA2RUR9 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC144AA2RUR9 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC144AA2RUR9 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC144AA2RUR9 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC144AA2RUR9 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC144AA2RUR9 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC144AA2RUR9 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC144AA2RUR9 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC144AA2RUR9 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC144AA2RUR9 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC144AA2RUR9 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC144AA2RUR9 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC144AA2RUR9 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC144AA2RUR9 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC144AA2RUR9 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC144AA2RUR9 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC144AA2RUR9 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC144AA2RUR9 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC144AA2RUR9 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC144AA2RUR9 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC144AA2RUR9 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC144AA2RUR9 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC144AA2RUR9 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC144AA2RUR9 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC144AA2RUR9 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC144AA2RUR9 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC144AA2RUR9 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC144AA2RUR9 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC144AA2RUR9 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC144AA2RUR9 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC144AA2RUR9 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC144AA2RUR9 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC144AA2RUR9 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC144AA2RUR9 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC144AA2RUR9 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC144AA2RUR9 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC144AA2RUR9 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC144AA2RUR9 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC144AA2RUR9 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC144AA2RUR9 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC144AA2RUR9 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC144AA2RUR9 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC144AA2RUR9 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC144AA2RUR9 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC144AA2RUR9 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC144AA2RUR9 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC144AA2RUR9 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC144AA2RUR9 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC144AA2RUR9 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC144AA2RUR9 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC144AA2RUR9 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC144AA2RUR9 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC144AA2RUR9 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC144AA2RUR9 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC144AA2RUR9 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC144AA2RUR9 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC144AA2RUR9 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC144AA2RUR9 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC144AA2RUR9 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms