Protein–RNA interactions for Protein: A2A3K4

PTPDC1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPDC1A2A3K4 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPDC1A2A3K4 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPDC1A2A3K4 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPDC1A2A3K4 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPDC1A2A3K4 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPDC1A2A3K4 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPDC1A2A3K4 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPDC1A2A3K4 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPDC1A2A3K4 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPDC1A2A3K4 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPDC1A2A3K4 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPDC1A2A3K4 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPDC1A2A3K4 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPDC1A2A3K4 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPDC1A2A3K4 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPDC1A2A3K4 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPDC1A2A3K4 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPDC1A2A3K4 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPDC1A2A3K4 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPDC1A2A3K4 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPDC1A2A3K4 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPDC1A2A3K4 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPDC1A2A3K4 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPDC1A2A3K4 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPDC1A2A3K4 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPDC1A2A3K4 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPDC1A2A3K4 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPDC1A2A3K4 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTPDC1A2A3K4 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTPDC1A2A3K4 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTPDC1A2A3K4 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTPDC1A2A3K4 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms