Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5K6

CD2AP, CD2-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD2APQ9Y5K6 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD2APQ9Y5K6 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD2APQ9Y5K6 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD2APQ9Y5K6 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CD2APQ9Y5K6 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD2APQ9Y5K6 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD2APQ9Y5K6 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD2APQ9Y5K6 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD2APQ9Y5K6 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD2APQ9Y5K6 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD2APQ9Y5K6 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD2APQ9Y5K6 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD2APQ9Y5K6 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD2APQ9Y5K6 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD2APQ9Y5K6 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD2APQ9Y5K6 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD2APQ9Y5K6 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD2APQ9Y5K6 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD2APQ9Y5K6 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD2APQ9Y5K6 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CD2APQ9Y5K6 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD2APQ9Y5K6 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CD2APQ9Y5K6 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CD2APQ9Y5K6 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD2APQ9Y5K6 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD2APQ9Y5K6 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD2APQ9Y5K6 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CD2APQ9Y5K6 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD2APQ9Y5K6 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CD2APQ9Y5K6 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD2APQ9Y5K6 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD2APQ9Y5K6 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD2APQ9Y5K6 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD2APQ9Y5K6 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD2APQ9Y5K6 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD2APQ9Y5K6 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD2APQ9Y5K6 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD2APQ9Y5K6 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD2APQ9Y5K6 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD2APQ9Y5K6 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD2APQ9Y5K6 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD2APQ9Y5K6 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD2APQ9Y5K6 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD2APQ9Y5K6 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD2APQ9Y5K6 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD2APQ9Y5K6 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD2APQ9Y5K6 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD2APQ9Y5K6 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD2APQ9Y5K6 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD2APQ9Y5K6 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD2APQ9Y5K6 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD2APQ9Y5K6 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CD2APQ9Y5K6 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CD2APQ9Y5K6 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD2APQ9Y5K6 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD2APQ9Y5K6 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD2APQ9Y5K6 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD2APQ9Y5K6 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD2APQ9Y5K6 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD2APQ9Y5K6 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CD2APQ9Y5K6 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD2APQ9Y5K6 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD2APQ9Y5K6 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD2APQ9Y5K6 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD2APQ9Y5K6 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD2APQ9Y5K6 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD2APQ9Y5K6 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD2APQ9Y5K6 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD2APQ9Y5K6 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD2APQ9Y5K6 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CD2APQ9Y5K6 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD2APQ9Y5K6 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CD2APQ9Y5K6 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CD2APQ9Y5K6 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CD2APQ9Y5K6 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CD2APQ9Y5K6 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
CD2APQ9Y5K6 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CD2APQ9Y5K6 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CD2APQ9Y5K6 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD2APQ9Y5K6 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD2APQ9Y5K6 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD2APQ9Y5K6 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD2APQ9Y5K6 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD2APQ9Y5K6 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD2APQ9Y5K6 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD2APQ9Y5K6 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD2APQ9Y5K6 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD2APQ9Y5K6 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD2APQ9Y5K6 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD2APQ9Y5K6 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD2APQ9Y5K6 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD2APQ9Y5K6 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD2APQ9Y5K6 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD2APQ9Y5K6 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CD2APQ9Y5K6 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD2APQ9Y5K6 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD2APQ9Y5K6 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD2APQ9Y5K6 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD2APQ9Y5K6 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD2APQ9Y5K6 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms