Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y448

KNSTRN, Small kinetochore-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNSTRNQ9Y448 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KNSTRNQ9Y448 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KNSTRNQ9Y448 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KNSTRNQ9Y448 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KNSTRNQ9Y448 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KNSTRNQ9Y448 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KNSTRNQ9Y448 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KNSTRNQ9Y448 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KNSTRNQ9Y448 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
KNSTRNQ9Y448 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KNSTRNQ9Y448 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KNSTRNQ9Y448 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
KNSTRNQ9Y448 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
KNSTRNQ9Y448 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KNSTRNQ9Y448 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KNSTRNQ9Y448 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KNSTRNQ9Y448 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KNSTRNQ9Y448 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KNSTRNQ9Y448 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KNSTRNQ9Y448 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KNSTRNQ9Y448 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KNSTRNQ9Y448 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KNSTRNQ9Y448 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KNSTRNQ9Y448 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KNSTRNQ9Y448 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KNSTRNQ9Y448 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KNSTRNQ9Y448 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KNSTRNQ9Y448 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KNSTRNQ9Y448 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
KNSTRNQ9Y448 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KNSTRNQ9Y448 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KNSTRNQ9Y448 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
KNSTRNQ9Y448 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
KNSTRNQ9Y448 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KNSTRNQ9Y448 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KNSTRNQ9Y448 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KNSTRNQ9Y448 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KNSTRNQ9Y448 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KNSTRNQ9Y448 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KNSTRNQ9Y448 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KNSTRNQ9Y448 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KNSTRNQ9Y448 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KNSTRNQ9Y448 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KNSTRNQ9Y448 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KNSTRNQ9Y448 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
KNSTRNQ9Y448 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KNSTRNQ9Y448 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KNSTRNQ9Y448 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KNSTRNQ9Y448 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KNSTRNQ9Y448 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KNSTRNQ9Y448 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KNSTRNQ9Y448 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KNSTRNQ9Y448 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KNSTRNQ9Y448 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KNSTRNQ9Y448 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KNSTRNQ9Y448 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KNSTRNQ9Y448 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KNSTRNQ9Y448 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KNSTRNQ9Y448 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KNSTRNQ9Y448 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KNSTRNQ9Y448 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KNSTRNQ9Y448 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KNSTRNQ9Y448 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KNSTRNQ9Y448 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KNSTRNQ9Y448 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
KNSTRNQ9Y448 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KNSTRNQ9Y448 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KNSTRNQ9Y448 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KNSTRNQ9Y448 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KNSTRNQ9Y448 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KNSTRNQ9Y448 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KNSTRNQ9Y448 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KNSTRNQ9Y448 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KNSTRNQ9Y448 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KNSTRNQ9Y448 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KNSTRNQ9Y448 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KNSTRNQ9Y448 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KNSTRNQ9Y448 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KNSTRNQ9Y448 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KNSTRNQ9Y448 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KNSTRNQ9Y448 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KNSTRNQ9Y448 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KNSTRNQ9Y448 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KNSTRNQ9Y448 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KNSTRNQ9Y448 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
KNSTRNQ9Y448 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KNSTRNQ9Y448 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KNSTRNQ9Y448 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KNSTRNQ9Y448 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KNSTRNQ9Y448 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KNSTRNQ9Y448 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KNSTRNQ9Y448 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KNSTRNQ9Y448 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KNSTRNQ9Y448 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KNSTRNQ9Y448 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KNSTRNQ9Y448 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KNSTRNQ9Y448 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KNSTRNQ9Y448 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KNSTRNQ9Y448 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KNSTRNQ9Y448 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms