Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3S2

ZNF330, Zinc finger protein 330, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF330Q9Y3S2 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF330Q9Y3S2 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF330Q9Y3S2 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF330Q9Y3S2 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF330Q9Y3S2 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF330Q9Y3S2 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF330Q9Y3S2 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF330Q9Y3S2 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF330Q9Y3S2 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF330Q9Y3S2 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF330Q9Y3S2 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF330Q9Y3S2 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF330Q9Y3S2 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF330Q9Y3S2 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF330Q9Y3S2 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF330Q9Y3S2 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF330Q9Y3S2 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF330Q9Y3S2 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF330Q9Y3S2 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF330Q9Y3S2 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF330Q9Y3S2 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF330Q9Y3S2 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF330Q9Y3S2 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF330Q9Y3S2 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF330Q9Y3S2 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF330Q9Y3S2 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF330Q9Y3S2 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF330Q9Y3S2 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF330Q9Y3S2 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF330Q9Y3S2 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF330Q9Y3S2 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF330Q9Y3S2 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF330Q9Y3S2 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF330Q9Y3S2 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF330Q9Y3S2 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF330Q9Y3S2 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF330Q9Y3S2 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF330Q9Y3S2 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF330Q9Y3S2 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF330Q9Y3S2 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF330Q9Y3S2 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF330Q9Y3S2 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF330Q9Y3S2 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF330Q9Y3S2 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF330Q9Y3S2 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF330Q9Y3S2 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF330Q9Y3S2 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF330Q9Y3S2 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF330Q9Y3S2 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF330Q9Y3S2 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF330Q9Y3S2 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF330Q9Y3S2 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF330Q9Y3S2 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF330Q9Y3S2 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF330Q9Y3S2 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF330Q9Y3S2 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF330Q9Y3S2 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF330Q9Y3S2 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF330Q9Y3S2 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF330Q9Y3S2 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF330Q9Y3S2 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF330Q9Y3S2 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF330Q9Y3S2 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF330Q9Y3S2 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF330Q9Y3S2 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF330Q9Y3S2 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF330Q9Y3S2 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF330Q9Y3S2 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF330Q9Y3S2 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF330Q9Y3S2 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF330Q9Y3S2 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF330Q9Y3S2 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF330Q9Y3S2 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF330Q9Y3S2 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF330Q9Y3S2 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF330Q9Y3S2 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF330Q9Y3S2 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF330Q9Y3S2 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF330Q9Y3S2 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF330Q9Y3S2 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF330Q9Y3S2 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF330Q9Y3S2 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF330Q9Y3S2 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF330Q9Y3S2 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF330Q9Y3S2 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF330Q9Y3S2 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF330Q9Y3S2 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF330Q9Y3S2 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF330Q9Y3S2 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF330Q9Y3S2 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF330Q9Y3S2 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF330Q9Y3S2 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF330Q9Y3S2 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF330Q9Y3S2 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ZNF330Q9Y3S2 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ZNF330Q9Y3S2 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ZNF330Q9Y3S2 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ZNF330Q9Y3S2 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF330Q9Y3S2 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF330Q9Y3S2 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms