Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

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Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SH3BP1Q9Y3L3 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SH3BP1Q9Y3L3 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SH3BP1Q9Y3L3 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SH3BP1Q9Y3L3 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SH3BP1Q9Y3L3 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SH3BP1Q9Y3L3 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SH3BP1Q9Y3L3 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SH3BP1Q9Y3L3 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SH3BP1Q9Y3L3 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SH3BP1Q9Y3L3 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SH3BP1Q9Y3L3 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SH3BP1Q9Y3L3 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SH3BP1Q9Y3L3 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SH3BP1Q9Y3L3 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SH3BP1Q9Y3L3 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SH3BP1Q9Y3L3 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SH3BP1Q9Y3L3 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SH3BP1Q9Y3L3 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SH3BP1Q9Y3L3 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SH3BP1Q9Y3L3 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SH3BP1Q9Y3L3 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SH3BP1Q9Y3L3 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SH3BP1Q9Y3L3 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SH3BP1Q9Y3L3 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SH3BP1Q9Y3L3 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SH3BP1Q9Y3L3 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SH3BP1Q9Y3L3 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SH3BP1Q9Y3L3 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SH3BP1Q9Y3L3 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SH3BP1Q9Y3L3 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SH3BP1Q9Y3L3 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SH3BP1Q9Y3L3 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SH3BP1Q9Y3L3 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SH3BP1Q9Y3L3 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SH3BP1Q9Y3L3 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SH3BP1Q9Y3L3 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SH3BP1Q9Y3L3 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SH3BP1Q9Y3L3 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SH3BP1Q9Y3L3 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
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SH3BP1Q9Y3L3 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SH3BP1Q9Y3L3 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SH3BP1Q9Y3L3 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SH3BP1Q9Y3L3 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SH3BP1Q9Y3L3 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SH3BP1Q9Y3L3 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SH3BP1Q9Y3L3 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SH3BP1Q9Y3L3 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SH3BP1Q9Y3L3 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SH3BP1Q9Y3L3 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SH3BP1Q9Y3L3 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SH3BP1Q9Y3L3 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
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SH3BP1Q9Y3L3 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SH3BP1Q9Y3L3 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SH3BP1Q9Y3L3 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
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SH3BP1Q9Y3L3 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
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SH3BP1Q9Y3L3 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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SH3BP1Q9Y3L3 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
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SH3BP1Q9Y3L3 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SH3BP1Q9Y3L3 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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SH3BP1Q9Y3L3 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SH3BP1Q9Y3L3 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SH3BP1Q9Y3L3 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SH3BP1Q9Y3L3 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SH3BP1Q9Y3L3 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SH3BP1Q9Y3L3 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SH3BP1Q9Y3L3 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SH3BP1Q9Y3L3 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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SH3BP1Q9Y3L3 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SH3BP1Q9Y3L3 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SH3BP1Q9Y3L3 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SH3BP1Q9Y3L3 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SH3BP1Q9Y3L3 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SH3BP1Q9Y3L3 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SH3BP1Q9Y3L3 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SH3BP1Q9Y3L3 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SH3BP1Q9Y3L3 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SH3BP1Q9Y3L3 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SH3BP1Q9Y3L3 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SH3BP1Q9Y3L3 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SH3BP1Q9Y3L3 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SH3BP1Q9Y3L3 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SH3BP1Q9Y3L3 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SH3BP1Q9Y3L3 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SH3BP1Q9Y3L3 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SH3BP1Q9Y3L3 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
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