Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2V7

COG6, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG6Q9Y2V7 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COG6Q9Y2V7 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COG6Q9Y2V7 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COG6Q9Y2V7 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COG6Q9Y2V7 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COG6Q9Y2V7 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COG6Q9Y2V7 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COG6Q9Y2V7 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COG6Q9Y2V7 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COG6Q9Y2V7 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COG6Q9Y2V7 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COG6Q9Y2V7 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COG6Q9Y2V7 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COG6Q9Y2V7 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COG6Q9Y2V7 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COG6Q9Y2V7 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
COG6Q9Y2V7 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COG6Q9Y2V7 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
COG6Q9Y2V7 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COG6Q9Y2V7 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COG6Q9Y2V7 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COG6Q9Y2V7 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COG6Q9Y2V7 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COG6Q9Y2V7 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COG6Q9Y2V7 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COG6Q9Y2V7 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
COG6Q9Y2V7 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
COG6Q9Y2V7 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
COG6Q9Y2V7 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
COG6Q9Y2V7 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
COG6Q9Y2V7 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
COG6Q9Y2V7 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
COG6Q9Y2V7 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
COG6Q9Y2V7 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
COG6Q9Y2V7 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
COG6Q9Y2V7 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
COG6Q9Y2V7 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
COG6Q9Y2V7 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COG6Q9Y2V7 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COG6Q9Y2V7 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COG6Q9Y2V7 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
COG6Q9Y2V7 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COG6Q9Y2V7 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
COG6Q9Y2V7 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
COG6Q9Y2V7 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COG6Q9Y2V7 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COG6Q9Y2V7 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
COG6Q9Y2V7 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COG6Q9Y2V7 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COG6Q9Y2V7 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
COG6Q9Y2V7 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
COG6Q9Y2V7 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COG6Q9Y2V7 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COG6Q9Y2V7 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COG6Q9Y2V7 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COG6Q9Y2V7 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COG6Q9Y2V7 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COG6Q9Y2V7 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COG6Q9Y2V7 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COG6Q9Y2V7 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
COG6Q9Y2V7 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COG6Q9Y2V7 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COG6Q9Y2V7 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COG6Q9Y2V7 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COG6Q9Y2V7 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COG6Q9Y2V7 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COG6Q9Y2V7 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COG6Q9Y2V7 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COG6Q9Y2V7 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COG6Q9Y2V7 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COG6Q9Y2V7 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COG6Q9Y2V7 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COG6Q9Y2V7 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COG6Q9Y2V7 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COG6Q9Y2V7 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COG6Q9Y2V7 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COG6Q9Y2V7 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COG6Q9Y2V7 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
COG6Q9Y2V7 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COG6Q9Y2V7 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COG6Q9Y2V7 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COG6Q9Y2V7 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COG6Q9Y2V7 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COG6Q9Y2V7 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COG6Q9Y2V7 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COG6Q9Y2V7 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COG6Q9Y2V7 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COG6Q9Y2V7 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
COG6Q9Y2V7 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COG6Q9Y2V7 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COG6Q9Y2V7 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COG6Q9Y2V7 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COG6Q9Y2V7 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COG6Q9Y2V7 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COG6Q9Y2V7 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COG6Q9Y2V7 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COG6Q9Y2V7 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COG6Q9Y2V7 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COG6Q9Y2V7 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COG6Q9Y2V7 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms