Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2T6

GPR55, G-protein coupled receptor 55, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR55Q9Y2T6 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GPR55Q9Y2T6 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GPR55Q9Y2T6 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GPR55Q9Y2T6 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GPR55Q9Y2T6 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GPR55Q9Y2T6 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GPR55Q9Y2T6 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GPR55Q9Y2T6 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GPR55Q9Y2T6 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GPR55Q9Y2T6 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GPR55Q9Y2T6 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GPR55Q9Y2T6 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GPR55Q9Y2T6 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GPR55Q9Y2T6 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GPR55Q9Y2T6 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GPR55Q9Y2T6 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GPR55Q9Y2T6 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GPR55Q9Y2T6 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GPR55Q9Y2T6 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GPR55Q9Y2T6 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GPR55Q9Y2T6 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GPR55Q9Y2T6 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GPR55Q9Y2T6 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GPR55Q9Y2T6 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
GPR55Q9Y2T6 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GPR55Q9Y2T6 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GPR55Q9Y2T6 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GPR55Q9Y2T6 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
GPR55Q9Y2T6 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GPR55Q9Y2T6 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GPR55Q9Y2T6 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GPR55Q9Y2T6 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GPR55Q9Y2T6 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GPR55Q9Y2T6 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GPR55Q9Y2T6 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GPR55Q9Y2T6 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GPR55Q9Y2T6 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GPR55Q9Y2T6 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GPR55Q9Y2T6 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GPR55Q9Y2T6 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
GPR55Q9Y2T6 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPR55Q9Y2T6 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPR55Q9Y2T6 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPR55Q9Y2T6 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPR55Q9Y2T6 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GPR55Q9Y2T6 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPR55Q9Y2T6 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPR55Q9Y2T6 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPR55Q9Y2T6 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPR55Q9Y2T6 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPR55Q9Y2T6 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPR55Q9Y2T6 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPR55Q9Y2T6 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPR55Q9Y2T6 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPR55Q9Y2T6 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPR55Q9Y2T6 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPR55Q9Y2T6 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GPR55Q9Y2T6 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GPR55Q9Y2T6 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPR55Q9Y2T6 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPR55Q9Y2T6 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPR55Q9Y2T6 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPR55Q9Y2T6 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPR55Q9Y2T6 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPR55Q9Y2T6 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPR55Q9Y2T6 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GPR55Q9Y2T6 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPR55Q9Y2T6 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPR55Q9Y2T6 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPR55Q9Y2T6 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPR55Q9Y2T6 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPR55Q9Y2T6 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPR55Q9Y2T6 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPR55Q9Y2T6 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPR55Q9Y2T6 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPR55Q9Y2T6 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPR55Q9Y2T6 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GPR55Q9Y2T6 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GPR55Q9Y2T6 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPR55Q9Y2T6 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPR55Q9Y2T6 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPR55Q9Y2T6 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPR55Q9Y2T6 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GPR55Q9Y2T6 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPR55Q9Y2T6 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPR55Q9Y2T6 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPR55Q9Y2T6 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPR55Q9Y2T6 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GPR55Q9Y2T6 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPR55Q9Y2T6 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPR55Q9Y2T6 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPR55Q9Y2T6 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPR55Q9Y2T6 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GPR55Q9Y2T6 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPR55Q9Y2T6 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPR55Q9Y2T6 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPR55Q9Y2T6 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GPR55Q9Y2T6 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPR55Q9Y2T6 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPR55Q9Y2T6 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms