Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K7

KDM2A, Lysine-specific demethylase 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM2AQ9Y2K7 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KDM2AQ9Y2K7 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KDM2AQ9Y2K7 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KDM2AQ9Y2K7 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KDM2AQ9Y2K7 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KDM2AQ9Y2K7 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KDM2AQ9Y2K7 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KDM2AQ9Y2K7 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KDM2AQ9Y2K7 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KDM2AQ9Y2K7 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KDM2AQ9Y2K7 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KDM2AQ9Y2K7 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KDM2AQ9Y2K7 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KDM2AQ9Y2K7 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KDM2AQ9Y2K7 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KDM2AQ9Y2K7 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KDM2AQ9Y2K7 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KDM2AQ9Y2K7 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KDM2AQ9Y2K7 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KDM2AQ9Y2K7 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KDM2AQ9Y2K7 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KDM2AQ9Y2K7 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KDM2AQ9Y2K7 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KDM2AQ9Y2K7 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KDM2AQ9Y2K7 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KDM2AQ9Y2K7 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KDM2AQ9Y2K7 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KDM2AQ9Y2K7 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KDM2AQ9Y2K7 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KDM2AQ9Y2K7 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KDM2AQ9Y2K7 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KDM2AQ9Y2K7 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KDM2AQ9Y2K7 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KDM2AQ9Y2K7 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KDM2AQ9Y2K7 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KDM2AQ9Y2K7 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KDM2AQ9Y2K7 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KDM2AQ9Y2K7 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KDM2AQ9Y2K7 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KDM2AQ9Y2K7 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
KDM2AQ9Y2K7 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
KDM2AQ9Y2K7 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
KDM2AQ9Y2K7 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
KDM2AQ9Y2K7 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
KDM2AQ9Y2K7 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
KDM2AQ9Y2K7 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
KDM2AQ9Y2K7 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
KDM2AQ9Y2K7 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KDM2AQ9Y2K7 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KDM2AQ9Y2K7 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KDM2AQ9Y2K7 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KDM2AQ9Y2K7 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KDM2AQ9Y2K7 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KDM2AQ9Y2K7 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KDM2AQ9Y2K7 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KDM2AQ9Y2K7 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
KDM2AQ9Y2K7 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KDM2AQ9Y2K7 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KDM2AQ9Y2K7 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KDM2AQ9Y2K7 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
KDM2AQ9Y2K7 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KDM2AQ9Y2K7 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
KDM2AQ9Y2K7 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
KDM2AQ9Y2K7 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KDM2AQ9Y2K7 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KDM2AQ9Y2K7 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KDM2AQ9Y2K7 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KDM2AQ9Y2K7 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KDM2AQ9Y2K7 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KDM2AQ9Y2K7 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KDM2AQ9Y2K7 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KDM2AQ9Y2K7 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KDM2AQ9Y2K7 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KDM2AQ9Y2K7 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KDM2AQ9Y2K7 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KDM2AQ9Y2K7 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KDM2AQ9Y2K7 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KDM2AQ9Y2K7 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KDM2AQ9Y2K7 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KDM2AQ9Y2K7 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KDM2AQ9Y2K7 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KDM2AQ9Y2K7 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KDM2AQ9Y2K7 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KDM2AQ9Y2K7 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KDM2AQ9Y2K7 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KDM2AQ9Y2K7 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KDM2AQ9Y2K7 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KDM2AQ9Y2K7 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KDM2AQ9Y2K7 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
KDM2AQ9Y2K7 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KDM2AQ9Y2K7 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KDM2AQ9Y2K7 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
KDM2AQ9Y2K7 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KDM2AQ9Y2K7 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
KDM2AQ9Y2K7 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KDM2AQ9Y2K7 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KDM2AQ9Y2K7 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KDM2AQ9Y2K7 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KDM2AQ9Y2K7 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KDM2AQ9Y2K7 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms