Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2F5

ICE1, Little elongation complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ICE1Q9Y2F5 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ICE1Q9Y2F5 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ICE1Q9Y2F5 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ICE1Q9Y2F5 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ICE1Q9Y2F5 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ICE1Q9Y2F5 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ICE1Q9Y2F5 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
ICE1Q9Y2F5 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ICE1Q9Y2F5 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ICE1Q9Y2F5 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
ICE1Q9Y2F5 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ICE1Q9Y2F5 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ICE1Q9Y2F5 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ICE1Q9Y2F5 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ICE1Q9Y2F5 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ICE1Q9Y2F5 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ICE1Q9Y2F5 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ICE1Q9Y2F5 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ICE1Q9Y2F5 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ICE1Q9Y2F5 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ICE1Q9Y2F5 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ICE1Q9Y2F5 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ICE1Q9Y2F5 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ICE1Q9Y2F5 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ICE1Q9Y2F5 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ICE1Q9Y2F5 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ICE1Q9Y2F5 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ICE1Q9Y2F5 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ICE1Q9Y2F5 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ICE1Q9Y2F5 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ICE1Q9Y2F5 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ICE1Q9Y2F5 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ICE1Q9Y2F5 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ICE1Q9Y2F5 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ICE1Q9Y2F5 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ICE1Q9Y2F5 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ICE1Q9Y2F5 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ICE1Q9Y2F5 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ICE1Q9Y2F5 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ICE1Q9Y2F5 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ICE1Q9Y2F5 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ICE1Q9Y2F5 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ICE1Q9Y2F5 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ICE1Q9Y2F5 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ICE1Q9Y2F5 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ICE1Q9Y2F5 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ICE1Q9Y2F5 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ICE1Q9Y2F5 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ICE1Q9Y2F5 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ICE1Q9Y2F5 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ICE1Q9Y2F5 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ICE1Q9Y2F5 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ICE1Q9Y2F5 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ICE1Q9Y2F5 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ICE1Q9Y2F5 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ICE1Q9Y2F5 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ICE1Q9Y2F5 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ICE1Q9Y2F5 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ICE1Q9Y2F5 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ICE1Q9Y2F5 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ICE1Q9Y2F5 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ICE1Q9Y2F5 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ICE1Q9Y2F5 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ICE1Q9Y2F5 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ICE1Q9Y2F5 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ICE1Q9Y2F5 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ICE1Q9Y2F5 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ICE1Q9Y2F5 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
ICE1Q9Y2F5 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ICE1Q9Y2F5 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ICE1Q9Y2F5 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ICE1Q9Y2F5 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ICE1Q9Y2F5 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ICE1Q9Y2F5 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ICE1Q9Y2F5 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ICE1Q9Y2F5 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ICE1Q9Y2F5 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ICE1Q9Y2F5 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ICE1Q9Y2F5 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ICE1Q9Y2F5 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ICE1Q9Y2F5 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ICE1Q9Y2F5 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ICE1Q9Y2F5 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ICE1Q9Y2F5 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms