Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E6

DTX4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX4Q9Y2E6 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DTX4Q9Y2E6 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DTX4Q9Y2E6 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DTX4Q9Y2E6 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DTX4Q9Y2E6 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DTX4Q9Y2E6 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DTX4Q9Y2E6 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DTX4Q9Y2E6 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DTX4Q9Y2E6 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DTX4Q9Y2E6 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DTX4Q9Y2E6 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DTX4Q9Y2E6 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
DTX4Q9Y2E6 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DTX4Q9Y2E6 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DTX4Q9Y2E6 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DTX4Q9Y2E6 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DTX4Q9Y2E6 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DTX4Q9Y2E6 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DTX4Q9Y2E6 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DTX4Q9Y2E6 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DTX4Q9Y2E6 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
DTX4Q9Y2E6 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
DTX4Q9Y2E6 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DTX4Q9Y2E6 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DTX4Q9Y2E6 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DTX4Q9Y2E6 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DTX4Q9Y2E6 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DTX4Q9Y2E6 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DTX4Q9Y2E6 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
DTX4Q9Y2E6 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DTX4Q9Y2E6 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DTX4Q9Y2E6 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DTX4Q9Y2E6 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DTX4Q9Y2E6 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DTX4Q9Y2E6 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DTX4Q9Y2E6 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DTX4Q9Y2E6 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DTX4Q9Y2E6 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DTX4Q9Y2E6 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DTX4Q9Y2E6 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
DTX4Q9Y2E6 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DTX4Q9Y2E6 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DTX4Q9Y2E6 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DTX4Q9Y2E6 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DTX4Q9Y2E6 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DTX4Q9Y2E6 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DTX4Q9Y2E6 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DTX4Q9Y2E6 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DTX4Q9Y2E6 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DTX4Q9Y2E6 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DTX4Q9Y2E6 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
DTX4Q9Y2E6 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
DTX4Q9Y2E6 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DTX4Q9Y2E6 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
DTX4Q9Y2E6 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DTX4Q9Y2E6 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DTX4Q9Y2E6 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
DTX4Q9Y2E6 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DTX4Q9Y2E6 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DTX4Q9Y2E6 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DTX4Q9Y2E6 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DTX4Q9Y2E6 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DTX4Q9Y2E6 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DTX4Q9Y2E6 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
DTX4Q9Y2E6 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DTX4Q9Y2E6 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DTX4Q9Y2E6 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DTX4Q9Y2E6 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DTX4Q9Y2E6 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
DTX4Q9Y2E6 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DTX4Q9Y2E6 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DTX4Q9Y2E6 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DTX4Q9Y2E6 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DTX4Q9Y2E6 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DTX4Q9Y2E6 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DTX4Q9Y2E6 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DTX4Q9Y2E6 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DTX4Q9Y2E6 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DTX4Q9Y2E6 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DTX4Q9Y2E6 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DTX4Q9Y2E6 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DTX4Q9Y2E6 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DTX4Q9Y2E6 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DTX4Q9Y2E6 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DTX4Q9Y2E6 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DTX4Q9Y2E6 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DTX4Q9Y2E6 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DTX4Q9Y2E6 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DTX4Q9Y2E6 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DTX4Q9Y2E6 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
DTX4Q9Y2E6 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
DTX4Q9Y2E6 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DTX4Q9Y2E6 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DTX4Q9Y2E6 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DTX4Q9Y2E6 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DTX4Q9Y2E6 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DTX4Q9Y2E6 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DTX4Q9Y2E6 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DTX4Q9Y2E6 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DTX4Q9Y2E6 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms