Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQL6

HDAC5, Histone deacetylase 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC5Q9UQL6 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HDAC5Q9UQL6 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms