Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV7

PHF24, PHD finger protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF24Q9UPV7 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PHF24Q9UPV7 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PHF24Q9UPV7 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PHF24Q9UPV7 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PHF24Q9UPV7 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PHF24Q9UPV7 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PHF24Q9UPV7 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PHF24Q9UPV7 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PHF24Q9UPV7 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PHF24Q9UPV7 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PHF24Q9UPV7 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PHF24Q9UPV7 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PHF24Q9UPV7 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PHF24Q9UPV7 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PHF24Q9UPV7 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PHF24Q9UPV7 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PHF24Q9UPV7 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PHF24Q9UPV7 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PHF24Q9UPV7 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PHF24Q9UPV7 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PHF24Q9UPV7 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PHF24Q9UPV7 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PHF24Q9UPV7 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PHF24Q9UPV7 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PHF24Q9UPV7 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PHF24Q9UPV7 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PHF24Q9UPV7 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PHF24Q9UPV7 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PHF24Q9UPV7 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
PHF24Q9UPV7 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
PHF24Q9UPV7 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
PHF24Q9UPV7 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
PHF24Q9UPV7 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PHF24Q9UPV7 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PHF24Q9UPV7 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
PHF24Q9UPV7 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PHF24Q9UPV7 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PHF24Q9UPV7 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PHF24Q9UPV7 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PHF24Q9UPV7 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PHF24Q9UPV7 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PHF24Q9UPV7 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PHF24Q9UPV7 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PHF24Q9UPV7 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PHF24Q9UPV7 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PHF24Q9UPV7 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PHF24Q9UPV7 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PHF24Q9UPV7 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PHF24Q9UPV7 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PHF24Q9UPV7 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PHF24Q9UPV7 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PHF24Q9UPV7 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PHF24Q9UPV7 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PHF24Q9UPV7 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PHF24Q9UPV7 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PHF24Q9UPV7 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PHF24Q9UPV7 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PHF24Q9UPV7 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PHF24Q9UPV7 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PHF24Q9UPV7 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PHF24Q9UPV7 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PHF24Q9UPV7 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PHF24Q9UPV7 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PHF24Q9UPV7 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
PHF24Q9UPV7 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PHF24Q9UPV7 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PHF24Q9UPV7 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PHF24Q9UPV7 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PHF24Q9UPV7 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PHF24Q9UPV7 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
PHF24Q9UPV7 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PHF24Q9UPV7 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PHF24Q9UPV7 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
PHF24Q9UPV7 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PHF24Q9UPV7 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PHF24Q9UPV7 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PHF24Q9UPV7 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PHF24Q9UPV7 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PHF24Q9UPV7 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PHF24Q9UPV7 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PHF24Q9UPV7 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PHF24Q9UPV7 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PHF24Q9UPV7 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PHF24Q9UPV7 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PHF24Q9UPV7 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PHF24Q9UPV7 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PHF24Q9UPV7 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PHF24Q9UPV7 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PHF24Q9UPV7 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PHF24Q9UPV7 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PHF24Q9UPV7 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PHF24Q9UPV7 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PHF24Q9UPV7 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PHF24Q9UPV7 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PHF24Q9UPV7 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PHF24Q9UPV7 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
PHF24Q9UPV7 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PHF24Q9UPV7 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PHF24Q9UPV7 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PHF24Q9UPV7 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms