Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TTF2Q9UNY4 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TTF2Q9UNY4 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TTF2Q9UNY4 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TTF2Q9UNY4 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TTF2Q9UNY4 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TTF2Q9UNY4 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TTF2Q9UNY4 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TTF2Q9UNY4 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TTF2Q9UNY4 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TTF2Q9UNY4 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TTF2Q9UNY4 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TTF2Q9UNY4 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TTF2Q9UNY4 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TTF2Q9UNY4 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TTF2Q9UNY4 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TTF2Q9UNY4 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TTF2Q9UNY4 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TTF2Q9UNY4 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TTF2Q9UNY4 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TTF2Q9UNY4 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TTF2Q9UNY4 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TTF2Q9UNY4 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TTF2Q9UNY4 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TTF2Q9UNY4 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TTF2Q9UNY4 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TTF2Q9UNY4 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TTF2Q9UNY4 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TTF2Q9UNY4 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TTF2Q9UNY4 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TTF2Q9UNY4 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TTF2Q9UNY4 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TTF2Q9UNY4 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TTF2Q9UNY4 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TTF2Q9UNY4 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TTF2Q9UNY4 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TTF2Q9UNY4 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TTF2Q9UNY4 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TTF2Q9UNY4 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TTF2Q9UNY4 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TTF2Q9UNY4 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TTF2Q9UNY4 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TTF2Q9UNY4 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TTF2Q9UNY4 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TTF2Q9UNY4 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TTF2Q9UNY4 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TTF2Q9UNY4 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TTF2Q9UNY4 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TTF2Q9UNY4 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TTF2Q9UNY4 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TTF2Q9UNY4 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TTF2Q9UNY4 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TTF2Q9UNY4 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TTF2Q9UNY4 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TTF2Q9UNY4 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TTF2Q9UNY4 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TTF2Q9UNY4 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TTF2Q9UNY4 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TTF2Q9UNY4 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TTF2Q9UNY4 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TTF2Q9UNY4 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TTF2Q9UNY4 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TTF2Q9UNY4 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TTF2Q9UNY4 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TTF2Q9UNY4 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TTF2Q9UNY4 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TTF2Q9UNY4 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TTF2Q9UNY4 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TTF2Q9UNY4 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TTF2Q9UNY4 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TTF2Q9UNY4 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TTF2Q9UNY4 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TTF2Q9UNY4 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TTF2Q9UNY4 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TTF2Q9UNY4 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TTF2Q9UNY4 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TTF2Q9UNY4 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TTF2Q9UNY4 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TTF2Q9UNY4 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TTF2Q9UNY4 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TTF2Q9UNY4 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TTF2Q9UNY4 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TTF2Q9UNY4 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TTF2Q9UNY4 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TTF2Q9UNY4 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TTF2Q9UNY4 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TTF2Q9UNY4 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TTF2Q9UNY4 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TTF2Q9UNY4 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TTF2Q9UNY4 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TTF2Q9UNY4 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TTF2Q9UNY4 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TTF2Q9UNY4 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TTF2Q9UNY4 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TTF2Q9UNY4 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TTF2Q9UNY4 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TTF2Q9UNY4 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TTF2Q9UNY4 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TTF2Q9UNY4 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TTF2Q9UNY4 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms