Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms